童能靈深感連城深山僻壤，交通閉塞，信息不通，見聞不廣，在學(xué)術(shù)研討進展和成果方面，與中原一帶相比，相形見絀。他先到金陵（今南京）考察前朝遺跡，后到福州的鰲峰書院就讀。雍正九年（1731年），時任福建巡撫趙國麟（山東泰安人）在鰲峰書院講學(xué)，與童能靈相見恨晚，他將童能靈列于學(xué)生的首座，相與議論，轟動一時。同在書院修習(xí)的學(xué)子有與童能靈年紀(jì)相仿的，都以晚輩自居。其中，漳州曾為謙、建寧李鐘芳、清流伍文運等同輩人甚至還拜其為師。
為求朱子遺書，童能靈還帶著弟弟童能良、嗣子童祖創(chuàng)、孫童崐宗、童侖宗、童嶠宗一同到閩北訪武夷精舍（又稱紫陽書院、武夷書院、朱文公祠），研習(xí)朱子理學(xué)長達三年。期間，童能靈細致地研究了南宋時期朱熹、黃榦等撰寫的《儀禮經(jīng)傳通解》及河洛易、樂律等，把握家禮、鄉(xiāng)禮、學(xué)禮、邦國禮、士冠禮、祭禮等各種禮儀規(guī)范，探索河圖洛書易經(jīng)和樂律的精粹。童能靈還深入研究元代許衡的《魯齋集》和《授時歷》。此次研學(xué)經(jīng)歷，被他記載于《謁朱子精舍》詩二首中。《謁朱子精舍·其一》記載了他研學(xué)時的心情：“寒泉北面摳衣肅，庭草春風(fēng)拜手芬；幸讀遺文今就緒，長歌招隱出巖云。”而《謁朱子精舍·其二》寫道：“孝友由來聲利外，圣賢全與水云惺；寒棲館內(nèi)饒余地，大隱屏前且?guī)Ы?jīng)?！贝筚澪湟木岬暮畻^藏著豐富理學(xué)文化，保存著珍貴的朱子理學(xué)經(jīng)書。
從武夷精舍回連城后，童能靈徹底放棄科考，在家鄉(xiāng)潛心研學(xué)和教授學(xué)生。雍正十二年（1734年），童能靈看到冠豸山上群峰左迴高聳，山下文川九曲奔流，上有凌虛之頂?shù)撵`芝峰和五老峰，下有甘甜清冽金字泉水，于是在五老峰下的李氏修竹書院旁結(jié)草廬三間，名曰思廬。思廬仿朱熹武夷精舍的樣式而建，奉祀朱熹像于居中一間。童能靈還把武夷山帶回的茶樹苗栽種在旁邊，待新芽茁發(fā)后摘取，以武夷巖茶的制茶法制之，風(fēng)味與武夷巖茶一樣，清香滿室，回味甘醇。童能靈在冠豸山筑廬與栽種武夷茶樹的經(jīng)歷，被記載在他寫給摯友雷鋐（寧化人，在乾隆朝任左副都御史）的《四與雷宮詹貫一書》中。
冠豸山童能靈書齋思廬舊址（硯池花圃一帶，李元杰 攝）
在冠豸山下，童能靈與“孤館寒燈”相伴，潛心治學(xué)十余年，雖清貧困頓，但鉆研古代名家巨著，“商訂舊學(xué)”，從不懈怠。雍正十二年（1734年）冬，東宮詹事府太子詹事雷鋐（寧化人），到童能靈學(xué)館拜訪并悉心討論，時學(xué)館北面墻壁被大風(fēng)刮破，寒風(fēng)凜冽，童能靈以草薦障之。雷鋐感嘆他貧中有樂，佩服其專心治學(xué)之毅力。兩人在孤館中手舉寒燈，商研學(xué)問，日夜不知疲倦。
乾隆六年（1741年），連城知縣秦士望（安徽宿州人）一到任，就向當(dāng)?shù)剜l(xiāng)賢咨詢童能靈情況。秦士望還專程到冠豸山上拜訪童能靈，論列經(jīng)典，相談甚歡。乾隆九年（1744年），兵部尚書王安國（江蘇高郵人）對童能靈撰寫的《子朱子為學(xué)次第考》大為贊賞。福建巡撫周興健（江西新建人）在其任上到汀州視學(xué)，閱讀童能靈著述，深為契賞。
童能靈的學(xué)問傳承自濂洛關(guān)閩學(xué)派，“濂”指濂溪周敦頤，“洛”指洛陽程顥﹑程頤，“關(guān)”指關(guān)中張載，“閩”指福建朱熹，濂洛關(guān)閩學(xué)派為公認(rèn)的儒學(xué)后源、理學(xué)正脈。童能靈的著述甚多，對理學(xué)的學(xué)習(xí)研究極為深刻、見解獨到。他提出“以道自任者，一身之事，而其道則天下之道”，用以告誡學(xué)子，謹(jǐn)守治學(xué)之道、為民之道、治國之道并將之發(fā)揚光大，使之成為天下讀書人都共同遵守的“天下大道”。
童能靈治學(xué)成果頗豐，一生著書三十多種，其中，《理學(xué)疑問》《周易剩義》《樂律古義》《子朱子為學(xué)次第考》等書，在其生前已刊行于世。其父親童正心所著的《留村禮意》一書，童能靈為其補釋后，分《周禮分釋》《儀禮分節(jié)》《禮記分釋》三種成書，其生前均未刊印。乾隆元年（1736年），乾隆皇帝命總理事務(wù)王大臣等設(shè)館纂修《三禮》（《周禮》《儀禮》《禮記》）義疏，并下詔各地向朝廷報送學(xué)者研究《三禮》的學(xué)術(shù)成果。連城縣將童能靈補釋的《周禮分釋》《儀禮分節(jié)》《禮記分釋》逐級上送到三禮館供選用。此外，《大學(xué)說》《中庸說》《格致錄》《五倫說》《五行解》《九卦說》《天五地六解》《洪范剩義詩》《詩大小序說》《風(fēng)雅頌編次》《周子正蒙說》《張子正蒙說》《朱陸淵源考》《陽明要書評》《系辭上傳說》《中天河洛太極辨徵》《邵子經(jīng)世數(shù)辨》《蔡氏皇極數(shù)辨》《蔡氏律呂新書辨》《太宰九兩系民說》《清時新語輯要》《留村家學(xué)述》等遺稿，在童能靈生前也未得刊印。
童能靈《冠豸山堂文集》
乾隆二十二年（1757年），童能靈嗣子童祖創(chuàng)將其中的《格致錄》《五倫說》《九卦說》《天五地六解》《詩大小序說》《朱陸淵源考》《太宰九兩系民說》等著作和童能靈往來書信、詩詞等編匯成冊，名曰《冠豸山堂文集》，該書至今仍存于世。
